2-2-4-1 نسبت برابری زمین…………………………………………………………………. 14
2-2-5 اهمیت کشت مخلوط لگوم و گراس…………………………………………………… 14
2-3-1 کاربرد کودهای شیمیایی و بیولوژیک در کشاورزی…………………………………… 15
2-3-2 کودهای بیولوژیک……………………………………………………………………….. 17
2-3-3 باکتری های حل کننده فسفات…………………………………………………………. 19
2-3-4 کود فسفر زیستی……………………………………………………………………….. 20
2-3-5 اهمیت و نقش کود زیستی فسفر………………………………………………………. 21
2-3-6 مکانیسم عمل باکتریهای محرک رشد گیاه……………………………………………… 22
2-3-6-1 تثبیت بیولوژیکی نیتروژن………………………………………………………………. 23
2-3-6-2 افزایش فراهمی عناصر غذایی…………………………………………………………. 23
2-3-6-3 حلالیت فسفر……………………………………………………………………………… 24
2-3-6-4 اثرات باکتریهای محرک بر رشد و مورفولوژی ریشه………………………………….. 25
2-3-6-5 تولید هورمون های گیاهی……………………………………………………………… 25
2-3-6-6 تحریک همزیستی بین گیاه و قارچ……………………………………………………….. 26
2-4 ذرت………………………………………………………………………………………………. 26
2-4-1 گستردگی گیاه ذرت………………………………………………………………………… 27
2-4-2 دلایل اهمیت ذرت در بین گیاهان زراعی………………………………………………… .28
اکولوژی ذرت……………………………………………………………………………………………. 28
2-5 خلر…………………………………………………………………………………………………. 29
2-5-1 اکولوژی خلر……………………………………………………………………………………… 30
2-5-2 ارزش غذایی و ترکیب شیمیایی گیاه خلر………………………………………………… 31
2-6 تأثیر کشت مخلوط بر عملکرد……………………………………………………………………. 32
2-7 تأثیر کشت مخلوط بر کیفیت علوفه………………………………………………………. 38
2-8 ارزیابی کشت مخلوط……………………………………………………………………………. 42
2-9 تأثیر کود فسفر زیستی بر عملکرد و کیفیت علوفه……………………………………………. 43
فصل سوم: مواد و روش ها
3- 1 مشخصات محل انجام آزمایش………………………………………………………………. 52
3-1-1 موقعیت جغرافیایی…………………………………………………………………………….. 52
3-1-2 اقلیم…………………………………………………………………………………………….. 52
3-2-2 مشخصات خاک محل آزمایش…………………………………………………………… 53
3-3 طرح و تیمارهای آزمایشی……………………………………………………………………. 53
3-4 ارقام مورد استفاده …………………………………………………………………………….. 54
3-5 مراحل انجام آزمایش…………………………………………………………………………….. 55
3-5-1 تهیه زمین……………………………………………………………………………………… 55
3-5-2 کاشت…………………………………………………………………………………………… 55
3- 5-3 تنک و وجین کردن……………………………………………………………………….. 56
3-5-4 عملکرد و اجزای عملکرد دانه…………………………………………………………….. 56
3-5-5 ارزیابی کیفیت علوفه…………………………………………………………………………. 56
3-5-6 ارزیابی کشت مخلوط……………………………………………………………………….. 57
3-6 تجزیه آماری……………………………………………………………………………………… 58
فصل چهارم : نتایج و بحث
4-1 ذرت……………………………………………………………………………………………….. 60
4-1-1 وزن هزار دانه…………………………………………………………………………………. 60
4-1-2 تعداد ردیف در بلال ذرت…………………………………………………………………… 62
یک مطلب دیگر :
4-1-3 تعداد دانه در ردیف ذرت………………………………………………………………….. 62
4-1-4 عملکرد دانه ذرت………………………………………………………………………….. 64
4-1-5 عملکرد بیولوژیک ذرت………………………………………………………………………. 68
4-1-6 شاخص برداشت……………………………………………………………………………. 60
4-2 خلر………………………………………………………………………………………………… 73
4-2-1 تعداد غلاف در بوته خلر……………………………………………………………………….. 73
4-2-2 تعداد دانه در غلاف خلر…………………………………………………………………………. 75
4-2-3 وزن هزار دانه خلر……………………………………………………………………………… 77
4-2-4 عملکرد دانه خلر………………………………………………………………………………. .78
4-2-5 عملکرد بیولوژیک خلر………………………………………………………………………….. 81
4-2-6 شاخص برداشت خلر……………………………………………………………………….. 83
4-3 ارزیابی کشت مخلوط………………………………………………………………………….. 84
4-4 ویژگی های کیفی علوفه……………………………………………………………………….. 85
4-4-1 درصد ماده خشک قابل هضم (DMD)………………………………………………………. 85
4-4-2 الیاف نامحلول در شوینده های خنثی (NDF)…………………………………………… 89
4-4-3 الیاف نامحلول در شوینده های اسیدی (ADF)…………………………………………. 93
4-4-4 کربوهیدراتهای محلول در آب (WSC)……………………………………………………. 94
4-4-5 پروتئین خام (CP)…………………………………………………………………………… 97
4-4-6 در صد خاکستر (Ash)…………………………………………………………………….. 101
4-5- نتیجه گیری…………………………………………………………………………………….. 102
پیشنهادات……………………………………………………………………………………………. 104
فصل پنجم : منابع
5-1 منابع……………………………………………………………………………………………… 106
چکیده:
به منظور بررسی اثرات کودهای فسفری زیستی و شیمیایی بر عملکرد و کیفیت علوفه در کشت مخلوط ذرت و خلر، در سال زراعی 89-1388 به طور همزمان دو آزمایش در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه شهید باهنر کرمان و مزرعه مجتمع اقتصادی کمیته امداد امام خمینی (ره) دشتکار در بردسیر کرمان به اجرا درآمد. آزمایش در هر دو محل، به صورت فاکتوریل در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با چهار تکرار اجرا شد. عوامل مورد بررسی شامل چهار سطح کود فسفری (فسفر زیستی، فسفر شیمیایی، 50 درصد فسفر زیستی +50 درصد فسفر شیمیایی و شاهد) و پنج الگوی کشت به روش جایگزینی (ذرت خالص و نسبتهای 75:25، 50:50 و 25:75 از ذرت و خلر و خلر خالص) بودند. تجزیه مرکب دادهها نشان داد که اثر مکان بر عملکرد و اجزای عملکرد به جز وزن هزار دانه ذرت و خلر معنیدار شد، به طوریکه وزن هزار دانه، عملکرد دانه و بیولوژیک و شاخص برداشت ذرت در کرمان به ترتیب 10، 19، 17 و 21 درصد بیشتر از بردسیر بود. در مقابل، تعداد دانه در غلاف، عملکرد دانه و عملکرد بیولوژیک خلر در بردسیر به ترتیب 42، 5 و 7 درصد بیشتر از کرمان بود. تاثیر نسبتهای مختلف کشت مخلوط و کودهای فسفری بر وزن هزار دانه، تعداد دانه در ردیف، عملکرد دانه و بیولوژیک و شاخص برداشت ذرت معنیدار شد. برهمکنش نسبتهای مختلف کشت مخلوط و کودهای فسفری بر تعداد غلاف در بوته، تعداد دانه در غلاف، عملکرد دانه و بیولوژیک و شاخص برداشت خلر معنیدار گردید و حداکثر آنها از کشت مخلوط 25:75 ذرت و خلر، توام با مصرف50 درصد فسفر زیستی +50 درصد فسفر شیمیایی حاصل گردید. ارزیابی نسبت برابری زمین نشان داد که اجرای نسبتهای مختلف کشت مخلوط سبب افزایش نسبت برابری زمین به بیش از یک گردید و بیشترین آن (15/2) در کشت مخلوط 25:75 ذرت و خلر مشاهده شد. کربوهیدراتهای محلول در آب، قابلیت هضم ماده خشک، پروتئین خام، درصد خاکستر، الیاف شوینده خنثی، الیاف شوینده اسیدی به شدت تحت تاثیر نسبتهای کشت قرار گرفتند و اعمال کودهای فسفری نیز بر آنها به جز درصد خاکستر تاثیر معنیداری داشت. قابلیت هضم ماده خشک، کربوهیدراتهای محلول در آب و پروتئین خام علوفه تحت تاثیر برهمکنش نسبتهای کاشت و کود فسفری قرار گرفت. نسبتهای مختلف کشت مخلوط ذرت و خلر نسبت به کشت خالص آنها دارای کیفیت علوفه بالاتری بودند که کیفیت برتر به دلیل قابلیت هضم ماده خشک، پروتئین خام، کربوهیدراتهای محلول در آب و درصد خاکستر بالاتر و الیاف شوینده خنثی و الیاف شوینده اسیدی پایینتر در کشت مخلوط ذرت و خلر بود. کاربرد کود زیستی فسفر توام با فسفر شیمیایی، بهبود کیفیت علوفه را به همراه داشت.
فصل اول: مقدمه
2-5- مرزه کلاری Satureja kallarica Ja.mzad ………………………………
2-5-1- گیاهشناسی……………………………………………………………. 22
2-4-2- اکولوژی مرزه بختیاری………………………………………………….. 23
2-5-2- اکولوژی مرزه کلاری…………………………………………………….. 23
2-4-3- پراکنش مرزه بختیاری…………………………………………………… 24
2-5-3- پراکنش مرزه کلاری……………………………………………………… 24
2-6- کشت و زراعت مرزه………………………………………………………. 25
2-7- فیتوشیمی جنس مرزه…………………………………………………… 26
2-8- خواص درمانی جنس مرزه……………………………………………….. 27
2-9- اسانس و مواد مؤثره ……………………………………………………….28
2-9-1- روشهای استخراج اسانس…………………………………………… 28
2-9-2- بیوشیمی اسانس……………………………………………………… 30
2-9-3- عوامل مؤثر بر اسانس………………………………………………….. 32
2-10- انواع ترکیبات ثانویه………………………………………………………. 35
2-11- فیتوشیمی………………………………………………………………..36
2-11-1- کاربرد فیتوشیمی……………………………………………………… 37
2-11-2- آشنایی با کروماتوگرافی گازی (GC) و طیفسنجی جرمی (MS)….37
2-11-3- فرآیند دستگاه…………………………………………………………. 39
2-11-4- روش GC-MS……………………………………………………………
2-12- بررسی منابع در خصوص فیتوشیمی اسانس گیاهان جنس مرزه…43
2- 13 – اهداف مورد مطالعه……………………………………………………. 49
فصل سوم: مواد و روشها
3-1- خصوصیات مناطق مورد مطالعه………………………………………….. 51
3-1-1- خصوصیات جغرافیایی مناطق مورد مطالعه…………………………… 51
3-1-2- خصوصیات خاکشناسی مناطق مورد مطالعه……………………….. 56
3-1-3- خصوصیات هواشناسی مناطق مورد مطالعه………………………… 57
3-2- روش بررسی خصوصیات گیاهشناسی…………………………………. 58
3-2-1- زمان جمعآوری گیاه……………………………………………………… 58
3-2-2- روش جمعآوری گیاه…………………………………………………….. 58
3-2-3- روش آمادهسازی گیاهان……………………………………………… 59
3-2-4- روش بررسی فیتوشیمیایی گیاهان…………………………………. 61
3-3- روش محاسبات آماری……………………………………………………. 65
فصل چهارم: نتایج و بحث
4-1- خصوصیات اکولوژیکی دو گونه مرزه بختیاری و کلاری……………………67
4-2- عملکرد اسانس…………………………………………………………….. 68
4-3- تجزیه فیتوشیمیایی اسانس ………………………………………………70
4-3-1- مرزه کلاری …………………………………………………………………70
4-3-2- مرزه بختیاری……………………………………………………………… 73
4-3-3- مرزه زراعی …………………………………………………………………74
4-3-4- مرزه خوزستانی…………………………………………………………… 75
4-4- مشاهدات میکرومورفولوژی مرزه کلاری و مرزه بختیاری…………………..84
4-5- نتیجهگیری کلی ……………………………………………………………. 85
4-6- پیشنهادات……………………………………………………………………..86
منابع…………………………………………………………………………………87
چکیده:
مرزه کلاری (Satureja kallarica Jamzad.) و مرزه بختیاری (Satureja bachtiarica Bunge.) متعلق به تیرهی نعناییان (Lamiaceae) ازگیاهان دارویی، معطر و اندمیک در ایران میباشند. مرزه کلاری گیاهی علفی چندساله است که در ارتفاعات کوه کلار به صورت خودرو رشد میکند. قسمتهای هوایی مرزه کلاری و مرزه بختیاری به ترتیب در دو مرحله از رشد (در زمان گلدهی و قبل از گلدهی) از کوه کلار و سبزکوه در استان چهارمحال و بختیاری جمعآوری شدند. تجزیه GC و GC/MS اسانس به دست آمده از قسمتهای هوایی مرزه کلاری 12 ترکیب را نشان داد که9/91٪ از کل اسانس را شامل میشود. عملکرد اسانس مرزه کلاری و مرزه بختیاری به ترتیب 15/0 و 39/1 میلیلیتر در 100 گرم ماده خشک اندام هوایی بودند. ترکیبات اصلی اسانس در مرزه کلاری پیپریتنون اکسید (2/71٪)، لیمونن (7/6٪) و پیپریتنون (4/5٪) است. ترکیب اصلی اسانس در مرزه بختیاری کارواکرول (4/46 ٪)، گاما – ترپینن (32/21 ٪) و پارا- سیمن (42/9٪) میباشد. هر دو اسانس مرزه کلاری و مرزه بختیاری در مونوترپنها به ویژه مونوترپنهای اکسیژنه غنی میباشد. در نهایت از تحقیق حاضر چنین میتوان نتیجه گرفت که این دو گیاه که از گونههای انحصاری ایران واندمیک استان چهارمحال و بختیاری هستند از نظر ریختی و به خصوص اسانس و ترکیبات ثانویه با یکدیگر تفاوت چشمگیری دارند. با توجه به نتایج تحقیق حاضر باید مدیریتی در جهت حفاظت از گیاهان انحصاری دارویی به خصوص گونهی مرزه کلاری که در خطر تهدید میباشد اعمال شود.
فصل اول: مقدمه و بیان مسئله
1-1- مقدمه
یک مطلب دیگر :
گیاهان دارویی[1] به گیاهانی گفته میشود که دارای مواد مؤثره[2] مشخصی باشند و در درمان بیماری یا پیشگیری از بروز آن در انسان یا دام مورد استفاده قرار گیرند و همچنین نام آنها در یکی از فارماکوپههای[3] معتبر بین المللی ذکر شده باشند (مجنون حسینی و دوازده امامی، 1386).
گیاهان دارویی از ارزش و اهمیت خاصی در تأمین بهداشت و سلامت جوامع، هم از لحاظ درمان و هم پیشگیری از بیماریها، برخوردار بوده و هستند. این بخش از منابع طبیعی قدمتی همپای بشر داشته و در طول نسلها یکی از مهمترین منابع تأمین غذایی و دارویی بشر بوده است (قاسمی، 1388). گرایش عمومی جامعه به استفاده از داروها و درمانهای گیاهی و به طور کلی فرآوردههای طبیعی، به ویژه در سالهای اخیر روبه افزایش بوده و مهمترین علل آن، اثبات آثار مخرب و جانبی داروهای شیمیایی از یک طرف و ایجاد آلودگیهای زیست محیطی که کره زمین را تهدید میکند، از سوی دیگر بوده است. در حال حاضر، حدود یک سوم داروهای مورد استفاده در جوامع انسانی را داروهایی با منشأ طبیعی و گیاهی تشکیل میدهد (آریا پور و میرزایی ملا احمد ، 1389).
اگرچه داروهای شیمیایی به طور سریع اثر بخشند ولی اکثر آنها عوارض جانبی نامطلوبی بر بدن انسان بر جای میگذارند. در حالی که مواد دارویی حاصل از گیاهان با آن که به تدریج تأثیرگذار میباشند، دارای اثرات مفیدی بوده و چندان اثرات جانبی ندارد. مواد مؤثره گیاهان، به خصوص عطریات و اسانسها، موارد استفادهی متعدد و متفاوتی در صنایع لوازم آرایش، صنایع مواد شیمیایی خانگی دارند، به طوری که بدون حضور مواد مؤثرهی مذکور، ساخت و تهیهی بسیاری از محصولات امکانپذیر نخواهد بود (امید بیگی، 1384).
جنس مرزه (Satureja) متعلق به تیرهی نعناعیان (Lamiaceae)، مشتمل بر حدود 200 گونهی علفی و درختچهای، که به طور وسیع در منطقهی مدیترانه، آسیا و آمریکای شمالی گسترده شده است (Cantino et al., 1992). در فلور ایران، این جنس با 12 گونهی متداول مشاهده شده میان رشته کوهها در قسمت جنوب غربی کشور بیان گردیده است (Jamzad, 1992 ; Rechinger, 1982).
همهی 9 گونهی اندمیک مرزه در فلور ایرانیکا گزارش شده است، دو گونهی مرزه کلاری (Satureja Kallarica Jamzad.) و مرزه بختیاری (Satureja Bachtiarica Bunge.) در منطقه چهارمحال و بختیاری، جنوب غربی ایران گسترده شدهاند (Mozaffarian, 2008).
قسمتهای هوایی و ترکیبات فرار مرزه به عنوان گیاه دارویی استفاده میگردد. مرزهها منبعی از ترکیبات فعال بیولوژیکی با ارزشاند. هر دو اندام هوایی و ترکیبات با ارزش مرزه، که منبعی از ترکیبات فعال بیولوژیکی هستند، درتهیهی داروهای عمومی و ترکیب شده با بسیاری از داروهای گیاهی استفاده میگردند (Mozaffarian, 2008). در ایران، گونههای مرزه به صورت متداول به عنوان چایی، چاشنی (ادویه و طعمدهنده)، و اهداف دارویی استفاده میشود (Bezic et al., 2009).
2-1- بیان مسئله
در سالهای اخیر محققان پژوهشهای زیادی در خصوص تهیه، تولید، فرآوری و اثر درمانی داروهای گیاهی بر انسان انجام دادهاند. اغلب آنها بر این اعتقادند که منابع گیاهی به دلیل فراوانی، سالم بودن و پایدار بودن، از ارزش قابل توجهی در مقایسه با داروهای شیمیایی برخوردارند. به همین دلیل اغلب محققان بر این باورند که اثر بخشی داروهای شیمیایی موجود، برای درمان انسان به دلیل افزایش مقاومت پاتوژنها به این داروها، روز به روز، در حال کاهش است. نتایج اکثر تحقیقات، مؤید این مطلب است که ترکیبهای ثانویهی موجود در گیاهان دارویی، سبب کاهش رشد و حتی مرگ اکثر پاتوژنها بالأخص باکتریها میشود. همچنین این مواد بر خلاف داروهای شیمیایی، مسمومیت کمی را در سلولهای میزبان ایجاد میکنند یا به عبارتی، اثرات جانبی داروهای طبیعی کمتر از داروهای مصنوعی است (قاسمی، 1388).
ماهیت طبیعی گیاهان دارویی باعث سازگاری بیشتر با بدن و رفع عوارض جانبی میشود. گیاهان دارویی به دلیل ماهیت طبیعی و وجود ترکیبات همولوگ دارویی در کنار هم، با بدن سازگاری بهتری دارند و معمولاً فاقد عوارض ناخواسته هستند، لذا به خصوص در موارد مصرف طولانی و در بیماریهای مزمن، بسیار مناسب میباشند. کشور ایران به تنهایی به اندازه چهار برابر قاره اروپا دارای شرایط اقلیمی برای تولید گیاهان دارویی است، از این رو تولید این گیاهان میتواند در کنار طلای سیاه، نام طلای سبز را وارد سبد اقلام صادراتی کشورمان قرار دهد (هاشمی نژاد و بهادری، 1387).
همانطور که میدانیم گیاهان دارویی مخازن غنی از متابولیتهای ثانوی یعنی مخازن مواد مؤثرهی اساسی بسیاری از داروها هستند. مواد مذکور اگرچه اساساً با هدایت فرآیندهای ژنتیکی ساخته میشوند، ولی ساخت آنها به طور بارزی تحت تأثیر عوامل محیطی قرار میگیرد. باتوجه به اینکه عوامل محیطی سبب تغییراتی در رشد گیاهان دارویی و کیفیت و کمیت مواد مؤثره آنها میگردد، زمانی محصول یک گیاه دارویی از نظر اقتصادی مقرون به صرفه است که مقدار متابولیتهای اولیه و ثانویهی آن به حد مطلوب رسیده باشد. بر پایهی تحقیقات انجام شده، عوامل محیطی محل رویش گیاهان دارویی در سه محور بر آنها تأثیر میگذارد: تأثیر بر مقدار کلی مادهی مؤثرهی گیاهان دارویی، تأثیر بر عناصر تشکیلدهندهی مواد مؤثره، تأثیر بر مقدار تولید وزن خشک گیاه.
نور، درجه حرارت، آبیاری و ارتفاع محل از مهمترین عوامل محیط رویش گیاهان دارویی میباشند که تأثیر بسیار عمدهای بر کمیت و کیفیت مواد مؤثرهی آنها میگذارند (امید بیگی، 1384).
نوع، تعداد و تنوع گونههای گیاهان دارویی بر اساس شرایط و موقعیت جغرافیایی هر منطقه متفاوت است. بخش عظیمی از تجارت، مربوط به گونههای گیاهی دارویی است که از طبیعت جمعآوری شده و بعضاً با شیوههای نادرست، نه تنها به انقراض نسل گونهها میانجامد، بلکه تنوع زیستی منطقه و جهان را نیز با خطر نابودی مواجه میسازد. استفاده مطلوب، منطقی و بهینه از این منابع، که به لحاظ فناوری بسیار کم هزینهتر و سادهتر از صنایع دارویی و شیمیایی است، میتواند مؤثر باشد (آریا پور و میرزایی ملا احمد، 1389).
با توجه به اینکه در حال حاضر مواد اولیه دارویی در ایران کمتر ساخته میشود و در صنعت داروسازی به طور ریشهای نیازمند این مواد میباشیم، استفاده از منابع گیاهان دارویی داخلی که از دیرباز در ایران به صورت وسیع و سنتی رواج داشته است، یکی از راههای کاهش این نیاز میباشد. امید است با توجه بیشتر و مضاعف نسبت به گیاهان دارویی، بتوانیم در آینده از این منبع عظیم ملی در داخل و در صادرات به خارج از کشور بهرهمند شویم (آزاد بخت، 1378).
فصل دوم: کلیات و بررسی منابع
1-2- گیاهان دارویی در جهان و ایران
در بین ملل جهان، مصریان قدیم را باید نخستین ملتی دانست که از گیاهان دارویی به طور غیر قابل تصوری استفاده مینمودند. استفاده از خواص گیاهان جهت درمان بیماریها، نزد ملل هند و اروپایی، رواج فراوان داشته است. دانشمندان یونانی نظیر تئوفراست، بقراط، ارسطو، جالینوس اشخاص نامداری در جهان بودند که در زمینهی درمانهای گیاهی خدماتی بسیار ارزنده به جامعهی بشری عرضه نمودند. در غالب کشورهای جهان، مراکزی وجود دارد که در آنها، گیاهان مفید دارویی و فرآوردههای آنها در معرض استفادهی مردم قرار میگیرد. زیرا به علت اعتقادی که مردم به اثرات درمانی گیاهان و بیزیان بودن آنها دارند، به مواد شیمیایی پناه نمیبرند و از گیاهان معرق استفاده میکنند (زرگری، 1374).
یک مطلب دیگر :
برای این که بتوان قطعهای از DNAی دلخواه (موسوم به Insert DNA) را با استفاده از شرایط طبیعی (in vitro) تکثیر کرده و برای مطالعات بیشتر استفاده نمود، لازم است DNA را توسط مولکولهای وکتور به سلولهای مورد نظر انتقال داد. در غیر این صورت، عمل انتقال، تکثیر و یا استخراج DNAی مورد نظر امکانپذیر نمیشود. نظر به این که قطعات تکثیر شده همه با هم یکسان هستند، این نوع متدولوژی به همسانهسازی DNA موسوم است. مولکولهای وکتور DNA (DNAVector) که خود DNA میباشند، بنا به داشتن توالی به خصوصی قادر هستند در سلولهای میزبان خود به تعداد زیادی تکثیر شوند. در این صورت قطعه DNAی دلخواه نیز به همراه وکتور خود تکثیر میشود.
وکتورهای DNA تنوع بسیار زیادی دارند. مهمترین عامل طبقهبندی آنها میزان ظرفیت حمل DNA به سلول میزبان است. قطعات DNA را میتوان از چند نوکلئوتید گرفته تا بیش از صد هزار نوکلئوتید توسط وکتورهای مناسب همسانهسازی نمود. به همین دلیل در طراحی اولیه باید ابتدا اندازه DNAی مورد نظر را مشخص و وکتور مناسبی انتخاب نمود. پلاسمیدها، فاژ λ، کاسمید و کروموزومهای مصنوعی مخمر(Yeast artification chromosom) از وکتورهایی هستند که بیش از سایر وکتورها مورد استفاده قرار میگیرد(Larry and Champness, 2007).
مشخصات کلی وکتورهای کلونینگ
وکتورهای مختلف DNA با تنوع بسیار زیاد، شامل اندازهها و ظرفیتهای حمل مختلف موجود می باشند، ولی دارای نقاط مشترک اساسی ذیل هستند:
مبدا همانندسازی[1]
همه وکتورها دارای توالیهای ویژهای هستند که توسط آنزیم DNA پلیمراز سلول میزبان شناسایی شده و به تعداد بسیار زیادتر از ژنوم خود میزبان تکثیر میشوند این
توالی به مبدا همانندسازی موسوم است و با Ori نشان داده میشود. برخی وکتورها حاوی دو نوع Ori برای تکثیر در دو نوع سلول میزبان می باشند. همانندسازی وکتور توسط DNA پلیمراز سلول میزبان، در این ناحیه شروع و در دو جهت (Bi-directional) مخالف هم ادامه مییابد.
نشانگرهای انتخابی[2]
همه وکتورها حامل ژنهایی هستند که به واسطه ایفایش آنها میتوان وجود وکتور را به سهولت در داخل سلول میزبان ردیابی نمود. متداولترین نشانگرها، ژنهایی هستند که فرآورده آنها باعث بروز مقاومت در برابر آنتیبیوتیکهای به خصوصی میشود. در صورتی که وکتور به داخل سلول میزبان حساس به یک آنتیبیوتیک انتقال یابد، میتواند در حضور همان آنتیبیوتیک زنده مانده و رشد کند. انواع نشانگرهای رایجی که مقاومت به آنتیبیوتیک به خصوصی را در سلول میزبان القاء میکنند، آمپی سیلین[3]، تتراسایکلین[4]، جنتامایسین[5]، کانامایسین[6] و استرپتومایسین[7] میباشند.
نشانگرهای ژنتیکی[8]
دسته دیگری از نشانگرها، ژنهایی هستند که عامل کنترل یک سری واکنشهای بیوشیمیایی هستند. و در حضور مواد زمینه خاصی واکنشهای به خصوصی را برمیانگیزند. مثلاً ژن LacZ که استفاده از آن بسیار متداول میباشد در صورت انتقال به سویهای از باکتری E. coli که این ژن را ندارد باعث تولید آنزیم بتا-گالاکتوزیداز میشود که میتواند روی مادهای بنام X-Gal اثر کرده و رنگ آبی در محیط اطراف سلول تولید کند. برای تشخیص اینکه سلول میزبان حاوی وکتور DNA است، استفاده از یک
یک مطلب دیگر :
الگوریتم پنگوئن گوگل بروزرسانی شد!
نوع نشانگر کافی است ولی برای اینکه بتوان ماهیت وکتور را در رابطه با حامل بودن DNA وارد شده بررسی نمود، استفاده از نشانگرهای ثانوی ضروری میباشد.
جایگاه کلونینگ متعدد[9] (MCS)
برای اینکه بتوان DNA وارد شده را با استفاده از مکانیسم نوترکیبی[10] وارد قسمت خاصی از DNAی وکتور کرد، در سادهترین روش کار لازم است با استفاده از آنزیمهای برش دهنده هر دو DNA را برش داده و قطعات برشی و سپس دو نوع DNA را به هم اتصال داد در وکتورهای جدید جایگاه کلونینگ یا MCS شامل توالیهایی است که حاوی توالیهای شناسایی و جایگاه برش برای آنزیمهای برش دهنده متعدد میباشد. در کلونینگ باید از آنزیمهایی استفاده کرد که فقط میتوانند یکبار DNA وکتور را مورد برش قرار دهند به همین دلیل این جایگاهها را جایگاه برشی منحصر به فرد مینامند. بنابر این MCS هر وکتور جایگاه برشی آنزیمهایی را ارائه میکند که در تمامی طول وکتور منحصر به فرد[11] هستند. اگرچه وجود MCS در یک وکتور الزامی است اما این جایگاه باید در مکان ویژهای در روی وکتور قرار گرفته باشد به طور رایج این محل در ناحیه ´5 ژن LacZ قرار دارد که وجود آن در این محل در تولید فرآورده این نشانگر اختلالی ایجاد نمیکند در صورت وارد کردن DNA در جایگاه MCS توالی این ژن مختل شده و عدم تولید کلونیهای آبی رنگ در حضور X-Gal وجود DNAی وارد شده را نشان میدهد.
جایگاه های پروموتر[12]
بسته به هدف کلونینگ، وکتورهای متفاوتی طراحی شدهاند و به منظور انجام عملیات مختلف، توالیهای ویژهای در یک یا دو ردیف MCS قرار داده شدهاند. این توالیهای الیگونوکلئوتیدی محل شناسایی و کنترل آنزیمهای مختلف از منابع متفاوت هستند که در سویههای مختلفE. coli موجود میباشند. به این ترتیب بایستی برای اهداف و عملیات بخصوص، وکتور و سویه باکتری مناسب و سازگاری را انتخاب نمود. ممکن است هدف از کلونینگ تولید و تکثیر DNA هدف، تولیدmRNA از DNAی هدف یا این که تولید فرآورده پروتئینی کد شونده از DNAی هدف باشد. وجود پروموترهای ویژه و آنزیمهای مربوطه انجام این نوع عملیات را برعهده دارند.
مثلاً RNA polimerase از باکتریوفاژهای مختلف کلون شده و سویههای تراریخته E. coli حاوی این ژنها میباشند. این نوع پلیمرازها از DNAهایی که در مجاورت توالی پروموتور مخصوص شان قرار داشته باشند، به تعداد زیادی نسخهبرداری کرده و mRNA ی زیادی تولید میشود. این نوع وکتور به وکتور نسخهبرداری موسوم است.
در صورتی که تولید مقادیر زیادی از پروتئین کد شونده توسط DNAی هدف مد نظر باشد، توالیهایی مربوط به پروموتر در ابتدای DNAی هدف قرار میگیرد که با بر هم کنش با ریبوزومها و فاکتورهای تولید پروتئین در سلول، باعث بالا رفتن میزان تولید پروتئینی میشود که به هیچ نحو مورد نیاز و استفاده باکتری نیست. این نوع وکتورها نیز به وکتور بیانی [13]موسوم هستند (محمودپور،1381).
[1]. Origen of replication
[2]. Selective Markes
[3]. Ampicillin
[4]. Tetracycline
[5]. Gentamicin
[6]. Kanamycin
[7]. Streptomycin
[8]. Genetic Marker
[9]. Multiple Cloning Site
[10]. Recombination
[11] . Unique Site
[12] .Promoter Site
[13]. Expression Vector